为配合京沪高铁开通，在市交通委的统一协调部署下，地铁4号线北京南站目前已完成车站设施设备的改造工作以及人员准备等各项工作，确保京沪高铁开通后车站客运组织的安全有序。
在硬件改造及升级方面，4号线北京南站新增进、出站闸机24部，北京南站闸机改移工作全部由公司独立筹划施工完成，由公司多个部门协作完成，前后分硬件设备迁移、系统软件的修改与升级、系统整体调试3个阶段推进。此外南站还新增自动售票机（TVM）10台、安检设备4台。目前以上设备均已全部安装到位并调试完毕，京沪高铁开通后可立即投入使用。
在车站设施及人员配备方面，车站东侧客服中心各项准备工作已就绪，在高铁开通后将投入使用，可增加三个人工售票坐席，加上现有的西侧客服中心，届时将有6个人工售票席位，人工售票能力可提升1倍。车站将根据设备、设施投入情况以及客流疏导需求，相应增加车站工作人员配置，以确保正常运营秩序及乘客安全。
在提高设备、设施可靠性方面，4号线对北京南站设备设施进行了全面检查，确保设备设施的可靠性及稳定性。同时，落实备品备件和应急物品的准备，确保抢险、抢修需求。另外，4号线还将在京沪高铁开通初期，安排相关专业人员在4号线北京南站进行值守，重点监护电扶梯、直梯、闸机、安全门等设备的运转情况，并要求各相关专业人员落实应急管理，确保24小时联络畅通，遇设备故障及时到达现场。
为有效应对未来有可能的大客流冲击，4号线完善了大客流组织方案，落实人员配置，并将根据客流情况增加导流设施，以配合客流组织等工作。4号线北京南站目前已在东、西进站口增加固定式导流围栏125米。
根据北京南站的车站及客流组织特点，为乘客更加便捷的进出站以及换乘，4号线北京南站增加了对出站及换乘信息的提示及指引，如在站台增加“去天安门、王府井请在西单换1号线”等人性化的标识。
行车组织方面，京沪高铁开通初期，京港地铁计划平日每天安排一组备用列车于11:00前到达公益西桥站待命，双休日再增加一组备用列车于16:00前到达新街口库线待命，运营控制中心将根据4号线的客流情况采取加开临客的方式。同时，控制中心将加强线路客流监控，及时调整运营调度方案及措施，确保运营秩序稳定。
在安保安检方面，地铁4号线北京南站安保安检人员增加至50名分二个班次在站内值守，加大对安检工作的引导和宣传，并将加强对重点部位的监控，加大巡查力度及密度。针对高铁客流特点，携带大件行李的乘客较多，京港地铁将加强对安检点的监控，安检工作遵循“逢包必检，逢液必查，逢疑必问”的原则，并加强与铁路、公安等部门的联动，做好安全保障工作。
根据铁路部门提供的信息，预计地铁4号线北京南站每日接驳客流量将达到12万人次左右，加之周边地区日均2万人次的客流量，4号线北京南站的全日进、出站量预计将达14万人次,比目前增加约50%。
宣武门站日前在两个换乘通道共新增加了16组风扇，以进一步提升乘客的出行舒适度。