2020年端午假期期间（6月25日至6月27日），京港地铁所辖各线总客运量共计119.7万人次。其中，4号线及大兴线客运量共计59万人次，14号线客运量共计51.9万人次，16号线北段客运量共计8.8万人次。
三天假期期间，4号线及大兴线共计开行列车1662列次；14号线共计开行列车1806列次；16号线北段共计开行列车768列次。京港地铁所辖各线客运组织整体平稳有序，保障了假期期间乘客的顺畅出行。
今年端午假期期间，京港地铁所辖各线总体客流较去年相比有所下降，其中4号线及大兴线进出站量较多的车站为北京南站、西单站、新宫站；14号线进出站量较多的车站为望京南站、将台站、九龙山站；16号线北段进出站量较多的车站为北安河站、永丰站。京港地铁所辖各线换乘站中，日均换乘量较多的车站有西直门站、望京站及金台路站。
端午假期仍处于防疫期间，为保障乘客的出行安全，京港地铁持续强化各项消毒、通风等防控措施，强化客运组织，持续开展体温检测工作，并强化对乘客自身防护的宣传，为乘客安全、顺畅出行保驾护航。
为方便乘客出行，京港地铁所辖各线各车站均根据提前制定的客运组织方案，加强了站内客流监控，加大重点部位如出入口、闸机、安检机、站台等处的客流疏导力度；同时，各换乘站加强了对重点部位如换乘通道、楼梯等处的监控，及时对客流进行疏导，保障乘客在换乘通道及楼梯处的安全；此外，各车站还通过站内广播及时提示乘客出行路线。京港地铁的官方新浪微博也第一时间向乘客发布了实时运营信息，让乘客及时了解地铁客运情况。
假期期间，京港地铁的维修部门加强了对重点设备设施如车辆、安全门、电梯等的巡查次数和检修力度。各专业也安排人员在各线路上进行巡视，对设备运转情况进行监控，保障乘客安全，确保车辆及各系统设备安全、可靠、稳定运行。
此外，端午假期期间，京港地铁所辖各线坚持“人物同检”的原则，进一步加大了安检力度，共查出违禁品360件，全面保障了乘客的出行安全。