2012年清明假期期间（4月2日至4月4日），4号线与大兴线将采用双休日运行图组织行车，地铁4号线客运量预计将达318万人次，日均106万人次，大兴线客运量达65万人次，日均22万人次。清明假期期间，相关部门将密切关注客流情况，适时加开临客，确保乘客顺畅出行。
为做好清明节客运组织工作，4号线提前制定了运输保障方案。根据以往清明假期的客流数据，预计清明节客运高峰将出现在假期的4月2日和4月3日，期间早高峰的客流压力较大，尤其是西直门-动物园上行区间，4月2日和3日，4号线的日均客流预计将达112万人次，为此京港地铁计划在4月2日、3日的9：30-10：30期间，上行方向增开3列临客，并将密切关注客流变化，视情况采取继续增开临客等措施缓解客流压力。若遇大客流，动物园站将采取A口、B口、E口单进、D口单出的临时限流措施，以保障运营秩序及乘客安全。
受1号线八宝山扫墓客流影响，预计西单站换乘客流会有明显增加，为此，车站将加强客流组织安排及客流疏导。其它重点车站如北京南站、动物园站、中关村站等，将通过站内广播、乘客信息显示系统（PIS）、张贴临时引导标识及告示等方式，将相关信息及时通报乘客，保证车站客流组织顺畅与安全。
在大兴线方面，天宫院站已做好客流组织预案，以应对前往邻近天堂公墓可能出现的大客流情况。目前，天宫院站已做好了充分的人员安排，并将在站内增加广播提醒，在站内扶梯、站厅内、出站闸机处摆放天堂公墓扫墓班车的提示信息牌，并在站厅内加装客流控制围栏等设备。车站还将密切监控客流情况，以适时加强客流疏导，合理引导扫墓客流进、出站，尽量减少排队现象，加快乘客进、出站速度。
另，考虑到客流的上升及晚高峰期间运行间隔的缩短，换乘站如西单站、宣武门站都提前做好了相关措施，如遇过大客流，将采取限时分流措施，以缓解客流压力，保证乘客安全。
为确保清明期间设备运行的安全、可靠、稳定，车辆部门将加强对车辆及相关设备的维护和保障，加大故障排查力度，确保列车及设备运转良好有序。维修保障部门将加强技术力量配置，加强对电扶梯、直梯、安全门、闸机等设备设施的维修维护。
假期期间，地铁4号线及大兴线将严格按照“逢包必检、逢液必查、逢疑必问”的原则，进一步强化安检措施，希望广大乘客继续给予支持和配合，共同营造良好的节日出行环境。